车辆抵押后发生重大交通事故，造成车辆全部损

针对您提出的问题，如果保险公司已经根据机动车交强险责任限额进行了赔偿，通常情况下，抵押公司无权再直接要求申请人赔偿车辆损失。因为《机动车交通事故责任强制保险条例》第二十一条规定，保险公司应在限额内赔偿。但如抵押合同中有特别约定，且该约定不违反法律规定，抵押公司可能依据合同向申请人追偿。这需要根据具体合同条款来判断。
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在不同情况下，赔偿流程有所不同：1.若事故责任在机动车一方，保险公司先行赔付，不足部分视抵押公司是否有过错而定。2.若事故非机动车所有人或管理人过错，由保险公司和车辆实际使用者共同赔偿。3.若抵押合同有特殊约定，赔偿后可能涉及抵押公司按合同向申请人追偿的流程。
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从法律角度看，保险公司赔偿后，申请人若对事故的发生有过错，可能需承担超出交强险限额部分的赔偿责任。同时，申请人需确保与抵押公司的合同约定不违反法律规定，否则可能因合同违约而承担额外的法律责任。此外，申请人还需配合保险公司和相关部门的事故调查。